Экспертиза может быть проведена только на основании вынесенного постановления следователя или определения (постановления) судьи, а исследование может быть проведено по обращению физических или юридических лиц.
Назначается психофизиологическая экспертиза при наличии неустранимых противоречий в показаниях участников процесса (свидетелей, потерпевших, обвиняемых, подозреваемых), в случае противоречия между показаниями и другими доказательствами по делу, а также при отсутствии доказательств.